La Banca Regionale Europea nasce nel 1995 dalla fusione tra la Cassa di risparmio di Cuneo, fondata nel 1855 e presenza costante nell'economia del territorio, e la Banca del Monte di Lombardia, nata nel 1987 dalla fusione tra la Banca del Monte di Milano e la Banca del Monte di Pavia e Bergamo. Nel 2000 la Banca Regionale Europea entra a far parte del gruppo bancario Banca Lombarda e Piemontese, mentre nel 2006 incorpora la Banca Cassa di Risparmio di Tortona.
L'anno seguente la Banca Regionale Europea entra a far parte del Gruppo UBI (Unione di Banche Italiane) e, nel 2012, incorpora il Banco di San Giorgio. Al 31 dicembre 2014, su 1560 sportelli di UBI Banca, il 13% è costituito dalla Banca Regionale Europea (208). Nel novembre 2016, nell'ambito del nuovo piano industriale del gruppo bancario, la Banca Regionale Europea è incorporata nella capogruppo.